自2008年下半年以來，根據中小企業特別是小微企業發展過程中面臨的新情況、新問題，國家、自治區不斷對稅收政策進行調整和完善，出臺了一系列的結構性減稅政策，積極為小微企業“減負”。據國家*巴音郭楞調查隊到相關部門和部分小微企業調查了解到，總體上看，2011年新疆巴州小微企業稅收優惠政策落實情況良好。據州*及*統計數據顯示，截止到2012年5月31日底，新疆巴州共有825戶小型微利企業享受優惠政策，共減免企業所得稅稅金247.81萬元，分別較上年同期增加9.7倍和7.6倍。但由于政策的優惠面偏窄、優惠力度偏弱、部分增值稅無法抵扣以及小微企業自身原因等因素，結構性減稅政策對新疆巴州小微企業影響較小。
　　
　　一、優惠面偏窄。由于結構性減稅有別于全面的減稅，是針對特定稅種、基于特定目的而實行的稅負水平消減。優惠范圍多集中于國家扶持產業和特定項目，如高新技術產業、紡織業、農產品加工業、農林牧漁業項目、國家重點扶持的公共基礎設施項目、符合條件的環境保護、節能節水項目等。而新疆巴州小微企業中，能夠享受優惠政策的企業較少。據國家*巴音郭楞調查隊抽樣調查顯示，新疆巴州規模以下工業企業基本屬于以利用自然資源和傳統制造加工為主的“資源型”和“傳統型”行業，有些“資源型”企業還因為資源稅稅率的調整而增加了繳納稅金。
　　
　　二、優惠力度偏弱。結構性減稅還有別于大規模的減稅，所實行的是小幅度、小劑量的稅負水平消減，意在從量上削減稅負水平，因此是“有限度而不是大量”的減稅。由于此次上調增值稅和營業稅起征點幅度不大，稅費減免的優惠政策讓個體工商戶和部分符合條件的微型企業得到更多實惠，但其他小微企業仍感覺優惠力度偏弱。如某農產品加工企業，其行業、年納稅額等條件都不符合增值稅、營業稅等優惠稅收的要求，只能享受借款合同印花稅，按照減免規定進行測算，該企業貸款500萬元，只能免去250元的印花稅，但相對對于45萬左右貸款利息只能是“杯水車薪”。
　　
　　三、部分增值稅無法抵扣。增值稅納稅人的劃分標準降低后，部分小微型企業被認定為一般納稅人，具有了增值稅開票權，能公平地參與市場競爭。但由于小微企業一般納稅人在很多采購行為中無法取得增值稅發票，導致增值稅進項稅額實際抵扣額小于應該抵扣額。如某印刷品制造企業，由于訂單不穩定，周轉資金少等原因，不能直接用現金從大廠家大批量地購買原材料，只能向小企業甚至是個體戶采購，而小企業和個體戶一般沒有增值稅進項發票，無法用來抵扣成本，無形中企業增值稅就會多交十幾個點。
　　
　　四、小微企業自身存在問題。一是核定征收企業比例高。由于小微企業會計賬目不健全，成本、費用無法查賬，在征管中往往采用核定征收的方式征收稅款，此類企業不征收所得稅，無法享受減免稅款優惠政策。據州*和*統計數據顯示，2011年，新疆巴州核定征收企業共3157戶，占企業納稅總戶數的34.3%。二是虧損企業比例高。由于只有盈利企業繳納所得稅，部分符合條件的繳稅企業才能享受稅收優惠政策，而在新疆巴州所有查賬征收企業中，近三成企業處于虧損狀態。據州*和*統計數據顯示，2011年，新疆巴州盈利企業共1863戶，占所有查賬征收企業的30.8%。三是部分小微企業人員素質較低。一方面由于很多小企業會計人員都是兼職或者企業賬目委托會計事務所代理，部分會計人員怕麻煩不愿意主動去稅務部門備案申請減免稅資格，另一方面小微企業管理經營者只注重生產經營情況，對財務稅收政策不清楚，也不能及時準確的掌握小微企業稅收優惠政策，及時督促會計人員去稅務部門備案。